שיתוף פעולה בין מחלקות (Interdepartmental Collaboration) הוא תהליך שבו יחידות שונות בארגון פועלות יחד, משתפות מידע, משאבים וידע, במטרה להשיג מטרות משותפות ולייעל תהליכים ארגוניים. שיתוף פעולה כזה מסייע לשבור מחסומים ארגוניים, לשפר חדשנות ולקדם קבלת החלטות מושכלת, תוך חיזוק תחושת אחריות קולקטיבית ושיתוף פעולה בין עובדים ממחלקות שונות.
מאמרים אקדמיים על שיתוף פעולה בין מחלקות עוסקים בסוגיות כגון מנגנונים לשיפור תקשורת בין-מחלקתית, תפקיד התרבות הארגונית בהצלחת שיתוף הפעולה, והשפעת היררכיות ויחסי כוח על תהליכי עבודה משותפים. המחקר מתמקד בשאלות כמו אילו גורמים מעודדים או מעכבים שיתוף פעולה בין מחלקות, כיצד ניתן למדוד את יעילותו, ואיך ניתן ליישם תהליכים וכלים לשיפור אינטגרציה בין צוותים שונים. מגמות עכשוויות במחקר כוללות חקר שיתוף פעולה במבנים היברידיים ודיגיטליים, שימוש בטכנולוגיות לניהול ידע ותהליכים משותפים, ובחינת הקשר בין שיתוף פעולה בין-מחלקתי לחדשנות, פרודוקטיביות ורווחת עובדים.
